Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC1

VPS39, Vam6/Vps39-like protein, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS39Q96JC1 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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VPS39Q96JC1 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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VPS39Q96JC1 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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VPS39Q96JC1 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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VPS39Q96JC1 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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VPS39Q96JC1 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VPS39Q96JC1 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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