Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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SYNE4Q8N205 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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SYNE4Q8N205 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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SYNE4Q8N205 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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SYNE4Q8N205 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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