Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PTPRD-AS1-201ENST00000430766 1959 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 STARD13-AS-224ENST00000608496 787 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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