Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
NEUROD1Q13562 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC9.34□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms