Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms