Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms