Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MIR6754-201ENST00000621121 66 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 NAGA-202ENST00000402937 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CYP8B1-202ENST00000437102 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL596202.1-201ENST00000435295 3088 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ADCY5-210ENST00000491190 3962 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ARHGEF15-202ENST00000421050 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SLC12A6-207ENST00000558667 3725 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 DCAF5-202ENST00000389997 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 NCALD-212ENST00000519508 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC010729.1-201ENST00000413960 1746 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TYRP1-203ENST00000388918 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RIPOR1-202ENST00000379312 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TAS2R4-201ENST00000247881 2378 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SLC38A11-201ENST00000303735 3737 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC096636.1-201ENST00000625140 3618 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SMIM7-221ENST00000627144 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 NRF1-205ENST00000393232 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 DDX23-201ENST00000308025 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 EXD2-201ENST00000312994 5107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 KIAA1191-212ENST00000614420 2631 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 L3MBTL3-207ENST00000529410 4518 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 S100P-201ENST00000296370 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 FCAR-201ENST00000345937 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TRBV10-1-201ENST00000390364 412 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 FCAR-208ENST00000391726 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL136380.2-201ENST00000411837 492 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TRBV30-201ENST00000417977 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL353705.3-201ENST00000418694 1250 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL355863.1-201ENST00000424331 293 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 COPZ1-202ENST00000455864 880 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC007849.1-201ENST00000469794 513 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AP001318.1-201ENST00000476981 321 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PLA2G12AP1-201ENST00000497678 568 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC138866.1-201ENST00000514522 497 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC103681.1-201ENST00000531663 423 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PROSER3-207ENST00000537459 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 LINC01982-201ENST00000572848 308 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CD209-208ENST00000593821 807 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC020914.5-201ENST00000595339 329 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 PTPN20-204ENST00000374346 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ACAD11-201ENST00000264990 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC110926.1-201ENST00000412499 2825 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 NFYC-213ENST00000447388 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ZNF859P-201ENST00000502859 1966 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SCN5A-205ENST00000423572 8362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ARL11-201ENST00000282026 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL138690.1-201ENST00000568811 2243 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ACAN-208ENST00000561243 7593 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CCNC-203ENST00000369220 2118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC025279.1-201ENST00000604430 4818 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 LYSMD1-201ENST00000368908 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC068733.1-202ENST00000531479 2456 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TRIM26-266ENST00000437089 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TIMM10B-201ENST00000254616 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 LACC1-201ENST00000325686 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 HSPA8-207ENST00000526110 1924 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 REN-202ENST00000638118 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SPDYE1-201ENST00000258704 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC007614.6-201ENST00000623729 2620 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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