Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms