Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q9Y3F1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9Y3F1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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