Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP3Q9Y2W7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms