Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP20Q9Y2K6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP20Q9Y2K6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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