Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC3Q9UQE7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC3Q9UQE7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms