Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNND2Q9UQB3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNND2Q9UQB3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms