Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDZRN3Q9UPQ7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms