Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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USP18Q9UMW8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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USP18Q9UMW8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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USP18Q9UMW8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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USP18Q9UMW8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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USP18Q9UMW8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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USP18Q9UMW8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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