Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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NRXN1Q9ULB1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
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NRXN1Q9ULB1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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NRXN1Q9ULB1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
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NRXN1Q9ULB1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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NRXN1Q9ULB1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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NRXN1Q9ULB1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
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NRXN1Q9ULB1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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NRXN1Q9ULB1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NRXN1Q9ULB1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NRXN1Q9ULB1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
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