Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PNMA2Q9UL42 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA2Q9UL42 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms