Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP21Q9UK80 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP21Q9UK80 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms