Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD3Q9UJU5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms