Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPUSD1Q9UJJ7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms