Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C9orf78Q9NZ63 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf78Q9NZ63 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms