Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TVP23BQ9NYZ1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms