Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RDH8Q9NYR8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RDH8Q9NYR8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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