Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLCO1C1Q9NYB5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLCO1C1Q9NYB5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms