Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A4Q9NY91 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms