Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP4R2Q9NY27 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP4R2Q9NY27 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP4R2Q9NY27 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP4R2Q9NY27 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP4R2Q9NY27 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP4R2Q9NY27 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP4R2Q9NY27 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP4R2Q9NY27 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP4R2Q9NY27 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms