Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC39A9Q9NUM3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC39A9Q9NUM3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms