Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC4BQ9NT99 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC4BQ9NT99 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms