Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RRP7BPQ9NSQ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms