Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELLSQ9NRZ9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms