Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLE3Q9NRF9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLE3Q9NRF9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLE3Q9NRF9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLE3Q9NRF9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLE3Q9NRF9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLE3Q9NRF9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms