Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLSPNQ9HAW4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSPNQ9HAW4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms