Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ELP3Q9H9T3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ELP3Q9H9T3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms