Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00574Q9H8X3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00574Q9H8X3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00574Q9H8X3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00574Q9H8X3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00574Q9H8X3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00574Q9H8X3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00574Q9H8X3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00574Q9H8X3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00574Q9H8X3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00574Q9H8X3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00574Q9H8X3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00574Q9H8X3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00574Q9H8X3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms