Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BCAS3Q9H6U6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCAS3Q9H6U6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms