Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF541Q9H0D2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms