Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBPF3Q9H094 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms