Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NLRP1Q9C000 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms