Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NSD3Q9BZ95 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSD3Q9BZ95 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms