Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP3-1Q9BYR8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms