Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PCGF6Q9BYE7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCGF6Q9BYE7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms