Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms