Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
THUMPD2Q9BTF0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THUMPD2Q9BTF0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms