Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TIMM29Q9BSF4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TIMM29Q9BSF4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TIMM29Q9BSF4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TIMM29Q9BSF4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TIMM29Q9BSF4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms