Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LARP6Q9BRS8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms