Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNS3Q9BQ31 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms