Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IFT140Q96RY7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT140Q96RY7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms