Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTAGE1Q96RT6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTAGE1Q96RT6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms