Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2Q96Q42 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2Q96Q42 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms