Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC7Q96NW7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC7Q96NW7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms